Коллегиальные органы управления МАОУ «Экспериментальный лицей «Научно-образовательный комплекс» (в соответствии с Уставом НОК):

1. Общее собрание (конференция) работников;
2. Совет Научно-образовательного комплекса;
3. Наблюдательный совет;
4. Родительский совет;
5. Педагогический совет;
6. Научно-методический совет.

Структурных подразделений нет.

В МАОУ «Экспериментальный лицей «Научно-образовательный комплекс» действуют на добровольной основе

1. Детская фракция Совета Научно-образовательного комплекса;
2. Родительский комитет.